Выделение семенных растений в отдельную группу относится к началу XX века, когда на смену делению растений на тайнобрачные, или криптогамы (лат. Cryptogamae), — с «невидимыми» половыми органами — и явнобрачные, или фанерогамы (лат. Phanerogamae), — с заметными репродуктивными структурами — пришла новая система, согласно которой растения делились на четыре группы:

• Низшие растения, или талломные, или слоевцовые (Thallophyta);
• Моховидные (Bryophyta);
• Папоротниковидные (Pteridophyta);
• Семенные растения (Spermatophyta).

Семенные растения считались ботаническим таксоном в ранге надотдела и включали два отдела:

• Голосеменные (Gymnospermae);
• Покрытосеменные (Angiospermae).

В современных системах классификации растений выражение Семенные растения не является названием ботанического таксона. Вместе с тем оно используется в качестве неформального собирательного термина, объединяющего пять современных и один вымерший отделы растений:

• † Семенные папоротники, или Птеридоспермы (Pteridospermatophyta);
• Гинкговидные (Ginkgophyta);
• Гнетовидные (Gnetophyta);
• Саговниковидные (Cycadophyta);
• Хвойные, или Сосновые (Pinophyta);
• Покрытосеменные, или Цветковые (Magnoliophyta).

В 35-м издании учебника ботаника Страсбургера^[нем.] (2002, русский перевод — 2007) все пять групп современных семенных растений рассматриваются как имеющие одинаковые таксономические ранги — классы^[1].

Нет единого мнения относительно родственных связей между различными группами семенных растений. В течение второй половины XX века большинство учёных считало голосеменные группой, парафилетической по отношению к цветковым растениям, однако современные работы, связанные с анализом последовательностей ДНК, показали, что современные голосеменные всё же являются монофилетической группой^[1]. Некоторые ботаники, например, А. Б. Шипунов, предлагают считать семенные растения отделом, а перечисленные выше шесть таксонов — классами^[2].

• Растения
• Семя

• Ботаника. Учебник для вузов: в 4 т. = Lehrbuch der Botanik für Hochschulen. Begründet von E. Strasburger, F. Noll, H. Schenck, A. F. W. Schimper. / 35. Auflage neubearbeitet von Peter Sitte, Elmar W. Weiler, Joachim W. Kadereit, Andreas Bresinsky, Christian Körner / П. Зитте, Э. В. Вайлер, Й. В. Кадерайт, А. Брезински, К. Кёрнер; на основе учебника Э. Страсбургера [и др.]; пер. с нем. Е. Б. Поспеловой, К. Л. Тарасова, Н. В. Хмелевской. — М.: Издательский центр «Академия», 2007. — Т. 3. Эволюция и систематика / под ред. А. К. Тимонина, И. И. Сидоровой. — С. 7—15. — 576 с. — 3000 экз. — ISBN 978-5-7695-2741-8 (рус.). — ISBN 978-5-7695-2746-3 (Т. 3) (рус.), ISBN 3-8274-1010-X (Elsevier GmbH) — УДК 58(075.8)
• Хржановский В. Г.  Курс общей ботаники. Часть 2. Систематика растений: Учебник для сельхозвузов. — 2-е изд., перераб. и доп. — М.: Высшая школа, 1982. — С. 16—18.

• Семенные растения — статья из Большой советской энциклопедии. 
• Семенные растения // Энциклопедический словарь Брокгауза и Ефрона : в 86 т. (82 т. и 4 доп.). — СПб., 1890—1907.
• Фанерогамы // Энциклопедический словарь Брокгауза и Ефрона : в 86 т. (82 т. и 4 доп.). — СПб., 1890—1907.